Synopsis
Le 19 juillet 2019, Lincoln Six Echo et Jordan Two Delta vivent avec d'autres dans un complexe isolé. Cette communauté dystopique est régie par un ensemble de règles strictes. On dit aux résidents que le monde extérieur est devenu trop contaminé pour soutenir la vie, à l'exception d'une île exempte d'agents pathogènes. Chaque semaine, un résident quitte l'enceinte et part vivre sur l'île grâce à une loterie.
Lincoln commence à avoir des rêves dont il sait qu'ils ne sont pas issus de ses propres expériences. Le Dr Merrick, un scientifique et directeur du complexe, est inquiet et place des sondes dans le corps de Lincoln pour surveiller son activité cérébrale. Alors qu'il visite secrètement une installation électrique interdite dans le sous-sol où travaille le technicien James McCord, Lincoln découvre un papillon de nuit vivant dans un puits de ventilation, ce qui l'amène à déduire que le monde extérieur n'est pas vraiment contaminé. Lincoln suit le papillon de nuit dans une autre section, où il découvre que la « loterie » est en fait un système pour éliminer sélectivement les habitants de l'enceinte, où le « gagnant » est ensuite utilisé pour le prélèvement d'organes, les grossesses de substitution et d'autres fins importantes.
Merrick apprend que Lincoln a découvert la vérité sur son existence, ce qui oblige celui-ci à s'échapper. Pendant ce temps, Jordan a été sélectionnée pour l'île. Lincoln et Jordan s'échappent de l'installation et émergent dans le désert. Lincoln lui explique la vérité et ils partent à la découverte du monde réel. Merrick engage le mercenaire burkinabé et ancien agent du GIGN Albert Laurent pour les retrouver et les ramener dans l'enceinte. Merrick explique à Laurent que si l'on dit au public que les clones sont maintenus dans un état végétatif persistant, des essais ont montré que les organes ne survivraient que si les clones avaient une conscience, ce qui est contraire aux lois eugéniques.
Lincoln et Jordan trouvent McCord, qui explique que tous les résidents de l'établissement sont des clones de riches clients (surnommés « sponsors ») et sont tenus ignorants du monde réel et conditionnés à ne jamais remettre en question leur environnement ou leur histoire. McCord fournit le nom du sponsor de Lincoln, le concepteur de yachts Tom Lincoln, à Los Angeles et les aide à se rendre à la station Yucca maglev, où ils montent à bord d'un train Amtrak pour Los Angeles avant que des mercenaires ne le tuent. À New York, la marraine de Jordan, la top model Sarah Jordan, est dans le coma à la suite d'un accident de voiture et a besoin de greffes de Jordan pour survivre. A New-York, les deux clones sont retrouvés et arrêtés par la vraie police qui a identifié la carte de McCord qu'ils viennent d'utiliser pour en savoir plus sur leurs sponsors, avant que l'équipe de Laurent puisse les intercepter. Ceux-ci s'en prennent aux policiers pour les récupérer, mais les deux clones, après une longue et très intense course-poursuite à travers Los Angeles, réussissent à échapper à leurs poursuivants et à la mort. Ils passent la nuit caché avant d'aller à la rencontre du sponsor de Lincoln, Tom, dont il a obtenu l'adresse lors de son « identification » par la police. Pendant ce temps à l'institut, le Dr Merrick tue un ami de Lincoln, Gandu Three Echo, car celui-ci commence à remettre en question son environnement comme Lincoln.
Lincoln rencontre Tom, qui lui donne des explications sur l'institut de clonage, ce qui fait que Lincoln se rend compte qu'il a gagné les souvenirs de Tom. Ce dernier accepte apparemment d'aider Lincoln et Jordan à révéler les crimes de Merrick au public, mais les trahit secrètement à Merrick et Laurent, car il a désespérément besoin du foie de Lincoln pour survivre à sa cirrhose. Cependant, Jordan, connaissant Lincoln par coeur, sait que Tom ment et refuse de les accompagner. Incitant Lincoln à partir avec lui, Tom l'amène dans une embuscade qui se traduit par une poursuite en voiture dans la banlieue de Los Angeles et se termine par Lincoln incitant Laurent à croire que Tom est le clone et le tue, lui permettant d'assumer l'identité de Tom. De retour chez celui-ci, Lincoln et Jordan cèdent à leurs envies romantiques et ont des relations sexuelles.
Merrick suppose qu'un défaut de clonage était responsable des souvenirs et du comportement de Lincoln, ce qui l'a amené, ainsi que toutes les futures générations de clones, à remettre en question leur environnement et même à puiser dans les souvenirs de leur sponsor. Pour éviter cela, il décide d'éliminer les quatre dernières générations de clones. Lincoln et Jordan prévoient cependant de libérer les autres clones. Se faisant passer pour Tom, Lincoln retourne dans l'enceinte pour détruire les projecteurs holographiques qui cachent le monde extérieur. Jordan se laisse prendre pour aider le plan de Lincoln. Laurent, qui a des scrupules moraux à propos du traitement des clones après avoir été témoin de leur combat pour la survie et appris que Sarah Jordan pourrait ne pas survivre même avec les greffes d'organes, aide Jordan. Après un long combat, Lincoln tue Merrick avec un fusil harpon, et les clones sont libérés, voyant le monde extérieur pour la première fois. Alors que Laurent abandonne apparemment sa vie de mercenaire, Lincoln et Jordan partent ensemble dans l'un des bateaux de Tom vers une île, réalisant leur rêve d'aller un jour dans un tel endroit.
